肠道菌群对类器官的构建时的影响（其实这个我问题我是想问林老师）

我本科的另一个导师是做肠道微生物的，林老师和学生交流中一直在讲小肠上皮的类器官构建，所以我就在想，肠道微生物菌群肯定会对小肠的发育与形成具有重要的影响，但是，其实我们养细胞都很怕的一件事，就是污染，我想听听您的或者林老师怎么看这个问题？用一些菌群细胞破碎后的提取物进行处理吗，或者细菌代谢物、上清、灭活菌、活菌共培养、微注射到类器官腔内、2D 单层暴露等方式？

刚查了资料，已有 protocol 专门讨论 intestinal organoid 与 microbes 的共培养方法。